清水祖师流传于民间的传说，充满浓厚的神话色彩，反映百姓对祖师驱邪斗恶、济世行善的崇仰之心

(一)"试剑石"
话说陈普足初筑清水，并不一帆风顺，常遇山鬼士扰，与争道场。一天，普足持剑，指对岩左险崖上的巨石，声扬一剑能叫巨石削分两半。山鬼不信，普足对准 石，把剑一挥，只听霹坜声响，顿见那高有两丈的大 石，竟被削半。滚下岩坑，尚存的对半，仍屹立于险崖间，后人称为试剑石，众鬼一见咋舌退避。
(二)"方池传浮杉"
当时建寺缺乏做大梁巨材，清水祖师开口说要买下山林中所有的“无尾杉”木材商心知山林中的“无尾杉”并不多，当即收下了清水师的钱并要清水祖师在五天里砍伐取货，逾期不能再砍伐取材了。说也真怪，清水祖师付钱后并不上山砍伐杉木，而是回到清水岩，并叫众僧徒在清水岩挖一个池塘，并在池中凿了一个洞孔，大家不知道这葫芦里卖的是什么药。第二晚上，突然狂风大作。山林中的杉木被大刮断吹倒了许多。第三天，清水祖师亲自到山林中去选取所需的大杉木，并放入林中的水沟中，然后回清水岩。这时，清水岩中哪个挖开的池塘洞孔里接连冒出清水祖师从林选取的巨杉，一根接着一概地出来，当出完第九根，第十根刚冒出头来的时候，一位小和尚说了声“够了”，于是那出头的第十根便立定不动了。这就是为什么直到今天，清水岩那池塘中的没事洞孔还留着一根露个头的杉材的原因。

(三)"袈裟收鬼众"
清水祖师在与山鬼斗争中屡屡获胜，山鬼很不服气，还想寻机捣乱。于是清水祖师就想出了一个计谋来对付。一天，清水祖师把袈裟铺在地上，自己端坐其中，这时，一群山鬼蜂拥而上，使劲地拉扯袈裟，清水祖师一动不动，还挑站似的口吻问众山鬼不敢进到拉扯，里来，山鬼以为自己的鬼众量大，便纷纷奔入袈裟里。只等众山鬼跳入袈裟里来，清水祖师猛地一甩，山鬼大多被摔死。从袈裟角逃窜出来的四个山鬼，连忙跪地求饶，发誓再也不敢作祟捣乱了，并愿为清水祖师效劳。于是清水祖师便将他们收为大殿的护法神，这就是今天仍立在清水法门的赵、王、苏、李四大元帅。

(四)"移雨泉州府"
真德秀迎请水祖师神像到泉州祈雨的故事。那年泉州大旱无雨，真德季一边高搭芦棚 ，供奉迎请来的清水祖师，一边发布告示，要前来祈雨的百姓多带纸钱香楮，堆叠在清水祖师神座下，暗示如 投疏祈褥在时天不下雨的话，就放火烧楮。那天正当中 ，突然电鸣电闪，大雨倾盆而下，知府斋中飘满的梧 桐树叶上，依稀可辨有四行诗句：“雨是江西雨，移来泉州府，老佛若无灵，浑身成火灰“，真德秀读罢，十 分敬佩，之后亲自送清水祖师神像回清水岩，并在前人题悬的“真人”匾上，再添上一个“真”字，也，以表 示自己的敬佩和崇仰。这两则传说，都是史实为证。
前者是： 明何乔远觉亭记云：“山有魔鬼害氓，师与约，临深涧，展 如桥，既满座，而 断。鬼多坠涧中逃入石 穴，师封闭之，无得出。又有驱虑之异。
后者是：元天历五年，福建大旱。泉州太守迎祈祷。属邑同日大雨。安邑广文叶文载，祈雨。神降乩诗云 ：“月在中天水在瓶，白云深处夜谈经，东风吹我下山去，且数空阶一叶 ”。果应， 日大雨。

（五）比法渡悦巾
山鬼见 石被削，知道"神剑"历害，无不惶恐，但见普足单身，自持鬼众，仍不示弱。普足解腰间 巾，运用法力,将巾分别拴在深壑两边的树干上，成为" 桥"，独自先渡过对岸.再问众鬼敢否也过 桥？群鬼未曾见过，便一跃而上，岂知帨巾竟半截裂摔于 底，鬼众成为鬼中之鬼。